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在中国科学院北京基因组磋磨所(国度生物信息中心),国度基因组科学数据中心副主任宋述慧是出了名的“能战、善战、胜战”。在基因数据领域深耕十余载,宋述慧和共事们将一组组“玄妙”的基因数据“收编入库”,建立起中国东说念主我方的数据系统。从陪跑到并跑再到领跑,一齐走来,繁难重重,宋述慧从未轻言废弃。她说:“国之所需,心之所向。为国度的茂盛郁勃孝敬科技力量,是后生科学家义箝制辞的背负。”
冲破枷锁建立中国东说念主我方的基因数据系统
在信息时期的海潮中,大数据已成为国度的策略资源,人命组学大数据更是如斯。
手脚中国科学院北京基因组磋磨所(国度生物信息中心)的一员,宋述慧从入职起便从事生物大数据科学与时期磋磨。“起初,我国粹者需要将基因测序数据提交到欧洲、好意思国、日本的磋磨机构,才能在海外报复学术刊物发表论文。”宋述慧先容。要赶走科技自立自立,必须建立属于中国东说念主我方的数据资源体系。
为此,2016年,中国科学院北京基因组磋磨所确立人命与健康大数据中心,开动建立咱们国度我方的生物信息大数据资源体系。
如何作念?谁来作念?作念什么?面临一系列问题,宋述慧教导团队从零开动,点点滴滴地征集信息、整理数据,如同为建造高楼打下地基。
“生物信息大数据不仅包括东说念主体的基因数据,还包括动植物、病原微生物等,看似不起眼的少许据,蚁集在沿途就有了大能量。”谈起我方的专科,宋述慧侃侃而谈。她说,关于东说念主类而言,磋磨东说念主体基因数据有助于分析东说念主类疾病,匡助东说念主们赶走高品性活命。中国手脚食粮大国,食粮安全至关报复,有了农作物基因数据库,科学家就能“找”出最相宜中国情状环境助长的农作物,甚而不错进行愈加精采无比化的分析,比如哪类大豆更相宜作念豆乳,哪类大豆更相宜用来制作动物饲料……这些数据分析将对育种起到撑握、联结、参考作用。
历程几年的不懈努力,宋述慧教导团队建立了我国具有自主常识产权的基因组序列变异“数据-信息-常识”资源库和表型存档库。这一收货的得到,不仅惩办了永恒困扰我国的“卡脖子”问题,更为人命科学磋磨提供了坚实的数据撑握。宋述慧团队建立的遗传变异信息库GVM,与海外闻明的dbSNP、EVA和GWASCatalog数据库相比好意思,被海外Cell出书集团推选为变异数据存档库。
数据的价值在于诈欺。宋述慧还教导团队攻克了大领域数据组织不停的时期难题,发展了一系列要津时期,建立了妥洽的变异组数据和关联常识分享不停体系,这一体系不仅服务于国内磋磨,更引诱了来自92个国度/地区的繁密用户,数据下载次数进步千万。我国在生物信息学领域的海外影响力从陪跑逐渐转为并跑、领跑。
科技抗疫搭建新冠病毒演化磋磨全新算法
新冠疫情期间,宋述慧团队监测病毒演变端正,力务实时追踪病毒变异,为新冠疫情防控研判提供有劲数据撑握。
忘忧草官网在线播放“新冠病毒的传播演化,进步了有纪录以来的任何一种病毒。思要打赢新冠病毒,就得找到病毒的‘痛点’,这时候数据分析就显得尤为报复。”宋述慧回忆,那时已有软件,分析一条数据概况需要几秒钟,关联词疫情防控期间,每天梗概荒谬百甚而数万条序列数据从各方蚁集而来。跟着数据的快速积累,已有近1700万条把握的数据,而那时的演化分析软件尚不可支握海量数据的快速领路。时期即是人命,必须要有更新、更快的分析软件才行。
手脚新式冠状病毒攻关团队变异组安靖东说念主,宋述慧教导团队快速参预了济急攻关新常态的使命阵势,分秒必争建成新冠病毒信息资源库,建立了全球新冠病毒序列变异自动化实时领路及动态演化监测追踪的分析才能,将分析速率普及到了20分钟500万条,大大普及了效用。为止2024年2月29日,RCoV19已服务全球181个国度/地区约40余万名访客,数据累计下载近112亿条。这项磋磨效果入选2020年度“中国生物信息学十猛推崇”、中国科学院2021年度科技更始亮点效果、2022宇宙互联网大会——科技之魅率先科技效果。
“新冠疫情防控充满深奥与挑战,有段时期内行居家办公,使命起来不分日夜,往往一边吃饭一边分析数据。”宋述慧嗟叹,历尽千帆,破浪前行,历程三年的打磨,团队还是建立起了数据整合、快速领路、演化监测追踪与预警推敲的全链条底层框架实时期体系,为疏忽改日可能存在的突发情况提供了可模仿的数据及警戒。
树德树东说念主基因科普进万家
科学的力量在于普及。宋述慧不仅在数据库里追求基因的奥妙,更奋发于将科学的种子播种到更多渴慕常识的心灵中。
基因组科学不单是是无出其右的学术磋磨,更是关乎每个东说念主健康与改日的实用常识。为了让更多东说念主了解基因的奥妙,意志到基因与平日活命的紧密磋磨,宋述慧积极参与院所科普小组行动,走进中小学校园、科技馆等,用阳春白雪的话语为孩子们揭开基因的玄妙面纱。在她的科普讲座中,基因不再是没趣的生物学术语,而是一个个天真实故事。她答复基因的发现历程,先容基因组测序的时期,解释基因如何影响东说念主们的健康和行动,用互动和动画的样子,让孩子们切躯壳验“小小科学家”的扮装,激励学生对科学的爱好和兴趣心。
宋述慧还通过线上节目和科普竹帛《写给孩子的科技前沿》,将基因组科学的种子撒向更广大的六合。她的答复和竹帛不仅涵盖了基因的基本常识,还先容了我国及宇宙上具有代表性的人命科学工程技俩,如东说念主类基因组决议、水稻基因组决议等,展示了基因组科学的最新效果和诈欺出路。
宋述慧的科普处事如同春风化雨、润物无声,她用本色行动评释了科学的精神,用常识的力量照亮了更多东说念主的心灵。在她的影响下,越来越多的东说念主开动温情和浮现基因组科学,越来越多的青少年本旨投身于科学的海洋。她培养的硕士磋磨生、博士磋磨生,不仅成为基因数据磋磨领域的重生力量,也传承着她的科普精神。
□本报记者孙艳欧美BT